FACULTAD DE TECNOLOGÍA MÉDICA COMPARACIÓN DE LA SUSCEPTIBILIDAD A Fosfomicina FRENTE A OTROS ANTIBIÓTICOS EN Escherichia coli y Klebsiella pneumoniae OBTENIDOS DE ORINA DE PACIENTES ONCOLÓGICOS CON INFECCIÓN DEL TRACTO URINARIO Línea de Investigación: Microbiología, parasitología e inmunología Tesis para optar el Título de Especialista en Microbiología AUTOR: Rupa Oquendo, Rocío ASESOR: Cruz Gonzales, Gloria Esperanza (ORCID: 0000-0003-1937-5446) JURADO: Guerrero Barrantes, Cesar Enrique Rojas León, Roberto Eugenio Astete Medrano, Delia Jessica Lima – Perú 2022 Índice Resumen ................................................................................................................................. 1 Abstract ................................................................................................................................... 2 I. Introducción .................................................................................................................... 3 1.1. Descripción y Formulación del Problema................................................................ 3 1.2. Antecedentes ............................................................................................................ 5 1.3. Objetivos .................................................................................................................. 6 1.3.1. Objetivo General .............................................................................................. 6 1.3.2. Objetivos Específicos ........................................................................................ 6 1.4. Justificación ............................................................................................................. 7 II. Marco Teórico ................................................................................................................. 9 2.1. Bases Teóricas ......................................................................................................... 9 III. Método ....................................................................................................................... 14 3.1. Tipo de Investigación ............................................................................................. 14 3.2. Ámbito Temporal y Espacial ................................................................................. 15 3.3. Variables de Estudio .............................................................................................. 15 3.4. Población y Muestra .............................................................................................. 16 3.5. Instrumentos ........................................................................................................... 17 3.6. Procedimientos ....................................................................................................... 17 3.6.1. Medios de cultivo y reactivos ......................................................................... 17 3.6.2. Equipos ........................................................................................................... 17 3.6.3. Otros ............................................................................................................... 17 3.6.4. Aislamiento de las cepas estudiadas ............................................................... 18 3.6.5. Identificación de las cepas aisladas ................................................................ 18 3.6.6. Determinación de la sensibilidad in vitro. ...................................................... 20 3.6.7. Índice de resistencia a múltiples antibióticos (IRMA) ................................... 22 3.7. Análisis de Datos ................................................................................................... 23 IV. Resultados .................................................................................................................. 24 4.1. Número de Pruebas de Susceptibilidad Antibiótica realizadas para E. coli y K. pneumoniae en el Periodo de Estudio 2017 - 2018........................................................... 24 4.2. Pruebas de Susceptibilidad Antibiótica para E. coli y K. pneumoniae Aisladas de Muestras de Orina según las Características Demográficas y Servicio de Procedencia de los Pacientes con Cáncer. .................................................................................................. 25 4.3. Frecuencia del Fenotipo BLEE en Aislamiento de E. coli y K. pneumoniae Asociadas a Infección Urinaria en Pacientes con Cáncer ................................................. 28 4.4. Actividad Inhibitoria de Fosfomicina (FOS) Frente a Aislamientos de E. coli y K. pneumoniae Causantes de Infección Urinaria en Pacientes con Cáncer........................... 31 4.5. Actividad inhibitoria de los aminoglucósidos Gentamicina (GEN) y Amikacina (AMK) frente a aislamientos de E. coli y K. pneumoniae causantes de infección urinaria en pacientes con cáncer. .................................................................................................... 33 4.6. Actividad Inhibitoria de las Quinolonas, Ciprofloxacino (CIP) y Norfloxacino (NOR), Frente a Aislamientos de E. coli y K. pneumoniae Causantes de Infección Urinaria en Pacientes con Cáncer. .................................................................................... 37 4.7. Actividad Inhibitoria de los Carbapenems, Imipenem (IPM), Meropenem (MEM) y Ertapenem (ETP), Frente a Aislamientos de E. coli y K. pneumoniae Causantes de Infección Urinaria en Pacientes con Cáncer. .................................................................... 41 4.8. Actividad Inhibitoria de los Betalactámicos Piperacilina/tazobactam (TZP) y Amoxicilina-Ácido Clavulánico (AMC) Frente a Aislamientos de E. coli y K. pneumoniae Causantes de Infección Urinaria en Pacientes con Cáncer........................... 46 4.9. Actividad Inhibitoria de la Cefalosporina Cefazolina (CZO) Frente a Aislamientos de E. coli y K. pneumoniae Causantes de Infección Urinaria en Pacientes con Cáncer. .. 50 4.10. Actividad Inhibitoria del Trimetoprim / Sulfametoxazol (SXT) y Nitrofurantoina (NIT) Frente a Aislamientos de E. coli y K. pneumoniae Causantes de Infección Urinaria en Pacientes con Cáncer. .................................................................... 52 4.11. Actividad Inhibitoria de las Cefalosporinas Ceftazidima, Ceftriaxona y Cefepima Frente a Aislamientos de E. coli y K. pneumoniae Causantes de Infección Urinaria en Pacientes con Cáncer. .................................................................................... 56 4.12. Análisis de Conglomerados Jerarquicos de los Patrones de Susceptibilidad Antibiotica en Aislamientos de E. coli y K. pneumoniae Causantes de Infección Urinaria en Pacientes con Cáncer. .................................................................................................. 60 4.13. Indice de Resistencia Múltiple a Antibióticos (IRMA) en Aislamientos de E. coli y K. pneumoniae Causantes de Infección Urinaria en Pacientes con Cáncer según el Fenotipo BLEE ................................................................................................................. 66 V. Discusión de resultados ................................................................................................. 71 VI. Conclusiones .............................................................................................................. 79 VII. Recomendaciones ...................................................................................................... 80 VIII. Referencias ................................................................................................................ 81 IX. Anexos ....................................................................................................................... 94 1 Resumen La Fosfomicina ha mostrado eficacia contra organismos resistentes a múltiples fármacos, incluidos los productores de β-lactamasas de espectro extendido (BLEE). El objetivo del presente estudio fue comparar la actividad in vitro de Fosfomicina con otros antibióticos contra Escherichia coli y Klebsiella pneumoniae según la producción de BLEE asociados a infecciones urinarias en pacientes oncológicos. La identificación y pruebas de susceptibilidad se realizaron mediante métodos de cultivo tradicionales y sistemas semi-automatizados. Los resultados más importantes indican que la Fosfomicina en E. coli muestra una alta actividad inhibitoria en BLEE negativas. En los BLEE positivos hay una alta actividad inhibitoria pero con un marcado incremento en los niveles de resistencia con respecto al grupo BLEE negativo. Para K. pneumoniae, la Fosfomicina muestra una alta actividad inhibitoria sobre las variantes BLEE positivas y negativas. El análisis de conglomerados jerárquico muestra que la Fosfomicina se encuentra en el conglomerado de antibióticos de mayor actividad sobre E. coli y K. pneumoniae indistintamente de la producción de BLEE. El índice de resistencia múltiple a antibióticos (IRMA) para los aislamientos de E. coli y K. pneumoniae BLEE positivas analizadas en este estudio indica que el 100 % de los aislamientos proceden de ambientes de riesgo con alta presión selectiva. En los aislamientos BLEE negativos, estos porcentajes fueron 14.7 y 20.4 % para E. coli y K. pneumoniae respectivamente. En conclusión, aunque el fenotipo BLEE positivo también ejerce un impacto sobre la susceptibilidad a Fosfomicina, este antibiótico aún conserva una importante actividad sobre E. coli y K. pneumoniae BLEE positivo preservando el uso de antibióticos de mayor potencia para situación de mayor complejidad. Palabras clave: Cáncer, BLEE, Escherichia, Klebsiella, antibiótico, Fosfomicina 2 Abstract Fosfomycin has shown efficacy against multidrug-resistant organisms, including extended- spectrum β-lactamase (ESBL) producers. The objective of the present study was to compare the in vitro activity of Fosfomycin with other antibiotics against Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae according to the ESBL production associated with urinary tract infections in cancer patients. Identification and susceptibility testing were performed using traditional culture methods and semi-automated systems. The most important results indicate that Fosfomycin in E. coli shows a high inhibitory activity in ESBL negative isolates. In ESBL-positive isolates, a high inhibitory activity is maintained, however, there is a marked increase in resistance levels with respect to the ESBL-negative group. In K. pneumoniae, Fosfomycin shows a high inhibitory activity on ESBL positive and negative variants. The hierarchical cluster analysis shows that Fosfomycin is in the cluster of antibiotics with the highest activity on isolates of E. coli and K. pneumoniae regardless of ESBL production. The index of multiple resistance to antibiotics (IRMA) for ESBL-positive isolates of E. coli and K. pneumoniae analyzed in this study indicates that 100 % of the isolates come from risk environments with high selective pressure. In ESBL-negative isolates, these percentages were 14.7 and 20.4 % for E. coli and K. pneumoniae, respectively. In conclusion, although the ESBL-positive phenotype also has an impact on susceptibility to Fosfomycin, this antibiotic still retains significant activity against ESBL-positive strains of E. coli and K. pneumoniae, preserving the use of higher-potency antibiotics for situations of higher risk. complexity. Keywords: Cancer, ESBL, Escherichia, Klebsiella, antibiotic, Fosfomycin 3 I. Introducción Las infecciones del tracto urinario (ITU) constituyen un problema clínico frecuente tanto a nivel comunitario como hospitalario. Una de las infecciones más comunes en pacientes con cáncer son las ITU (Custovic et al., 2014; See et al., 2016). Se ha informado de una amplia gama de bacterias como causa de ITU en pacientes con cáncer, de las cuales la familia Enterobacteriaceae es la más prevalente (Custovic et al., 2014). Es importante destacar que las infecciones son una de las complicaciones más graves y la principal causa de morbilidad y mortalidad en pacientes con cáncer (See et al., 2016). En los pacientes con cáncer hay factores de riesgo para la adquisición de infecciones, destacando la neutropenia y cateterismo de largo entre otros (Custovic et al., 2014; See et al., 2016). 1.1. Descripción y Formulación del Problema Por décadas los antibióticos representaron herramientas efectivas para el tratamiento de las enfermedades infecciosas, desafortunadamente su uso indiscriminado ha conducido a niveles de resistencia, tan elevados, que ponen en riesgo su efectividad. La resistencia a los antimicrobianos, ampliamente difundida en el mundo actual, es un problema crítico, con severo impacto económico, social y de salud pública (Ventola, s. f.). La creciente resistencia antimicrobiana ha afectado la evaluación y manejo de esto cuadros (Durán, 2018). En el caso de la ITU complicada y nosocomial, Escherichia coli sigue siendo el principal agente causante, seguida de la presencia de Klebsiella sp., Proteus spp., Pseudomonas aeruginosa, Enterobacter spp., y bacterias Gram positivas como Enterococcus spp., Staphylococcus saprophyticus, Staphylococcus aureus, Morganella morganii, Streptococcus agalactiae (Echevarría-Zarate et al., s. f.). 4 El uso indiscriminado de antibióticos en seres humanos y en animales, unido a la gran movilización que se da en las poblaciones humanas, hace que se vea facilitada la diseminación de bacterias multirresistentes, en especial las infecciones causadas por bacterias productoras de β-lactamasas de espectro extendido (BLEE) y otras bacterias Gram negativas multirresistentes. Las infecciones por bacterias productoras de BLEE son un serio problema en nuestro país, y desde principios del año 2000 se ha dado un aumento progresivo en la frecuencia de las infecciones causadas por estas bacterias, en especial E. coli y Klebsiella spp. Un estudio realizado en pacientes ambulatorios del Hospital Cayetano Heredia con infección del tracto urinario en el año 2015 se encontró que la frecuencia de E. coli productora de BLEE fue de 41% (Valdez, 2017). El incremento de resistencia bacteriana y la disminución en el desarrollo de nuevos antibióticos han requerido la reintroducción de la Fosfomicina, un antibiótico de amplio espectro de acción que se ha utilizado ampliamente para el tratamiento de infecciones urinarias por vía oral, mientras que su uso por vía intravenosa ha estado limitado a determinados países como España, Francia o Japón. El interés por este compuesto se ha incrementado en los últimos años por el aumento de infecciones causadas por bacterias multirresistentes con escasas opciones terapéuticas, frente a las cuales Fosfomicina parece mantener su actividad. Su uso se ha revalorizado presentándose como una alternativa de tratamiento frente a patógenos multirresistentes (Aguilar, 2017). En los últimos años, la mayoría de los estudios realizados en pacientes con cáncer solo se han centrado en las infecciones del torrente sanguíneo, y hay escasez de información con respecto a la resistencia antibiótica de bacterias Gram negativas aisladas de muestras de orina en pacientes con cáncer con sospecha de ITU en Perú. 5 1.2. Antecedentes El cáncer es la principal causa de muerte en todo el mundo, con 8.2 millones de muertes registradas en todo el mundo en 2012 (Babady, 2016). Los pacientes sometidos a cirugía (por cáncer o por otras razones) pueden sufrir una infección del tracto urinario como complicación de la cirugía, la cateterización o la cistoscopia (Cybulski et al., 2005). En pacientes con cáncer inmunocomprometidos, la infección del tracto urinario (ITU) es una de las principales causas de fiebre y morbilidad. La detección de la ITU es importante ya que la presentación atípica no es infrecuente en estos pacientes (Parikh & Bhat, 2015). Por ejemplo, Parikh y Bhat (2015) analizaron un total de 497 muestras de orina de pacientes con cáncer encontrando 100 positivas para crecimiento bacteriano, siendo E. coli (40 %) el microorganismo predominante seguido por K. pneumoniae (25 %) (Parikh & Bhat, 2015). Ellos también indican para los aislamientos analizados que la susceptibilidad de las bacterias Gram negativas a la colistina fue alta (100 %) seguida de los carbapenems (72 %) mientras que la resistencia es mayor a los aminoglucósidos (46 %), cefalosporinas (67 %) y fluoroquinolonas (90 %). Horna y Cols.(2005) observaron en el Instituto Nacional de Enfermedades Neoplásicas (INEN) que los aislamientos de enterobacterias uropatógenas de pacientes de consultorio externo mostraron una frecuencia de resistencia a ciprofloxacino del 49.5 % (47/95) y en los pacientes hospitalizados la resistencia alcanzo el 73 % (27/37) (Horna et al., 2012). La Fosfomicina está indicado para el tratamiento de las infecciones urinarias agudas no complicadas causadas por E. coli y Enterococcus faecalis (Giancola et al., 2017). Los datos de estudios in vitro muestran que un inconveniente de la Fosfomicina es que puede 6 asociarse con el desarrollo de resistencia a los fármacos (Falagas et al., 2008; Horii et al., 1999). Sin embargo, los estudios clínicos que involucran el uso de Fosfomicina para tratar la infección urinaria muestran que, en países donde esta droga se ha usado durante muchos años, aproximadamente el 3 % de los patógenos bacterianos son resistentes a la Fosfomicina, y este porcentaje prácticamente se ha mantenido igual durante varios años. Un estudio transversal en el Hospital Nacional Hipólito Unanue (HNHU) mostró un alto grado de resistencia (24 %, 64/266) a Fosfomicina en cepas de E. coli productoras de BLEE aisladas de orina (Lifonzo-Mucha et al., 2018). 1.3. Objetivos 1.3.1. Objetivo General  Comparar la actividad in vitro de Fosfomicina con otros agentes antimicrobianos de elección clínica contra aislados de E. coli y K. pneumoniae según la presencia o ausencia de producción de β-lactamasas de espectro extendido (BLEE) asociados a infecciones del tracto urinario en pacientes oncológicos del Instituto Nacional de Enfermedades Neoplásicas (INEN). 1.3.2. Objetivos Específicos  Describir la frecuencia de pruebas de susceptibilidad para E. coli y K. pneumoniae aisladas en muestra de orina según las características demográficas y servicio de procedencia de los pacientes con cáncer.  Describir la frecuencia del fenotipo BLEE en aislamiento de E. coli y K. pneumoniae asociadas a infección urinaria en pacientes con cáncer  Medir la actividad inhibitoria de Fosfomicina (FOS) frente a aislamientos de E. coli y K. pneumoniae causantes de infección urinaria en pacientes con cáncer. 7  Comparar la actividad inhibitoria de FOS frente a la actividad inhibitoria de los aminoglucósidos, quinolonas, carbapenems, antibióticos betalactámicos, cefalosporinas, Trimetoprim / Sulfametoxazol (SXT) y Nitrofurantoina (NIT) en aislamientos de E. coli y K. pneumoniae causantes de infección urinaria en pacientes con cáncer.  Analizar mediante conglomerados jerárquicos los patrones de susceptibilidad antibiótica observados para FOS y otros antibióticos en aislamientos de E. coli y K. pneumoniae causantes de infección urinaria en pacientes con cáncer según el fenotipo BLEE.  Calcular el índice de resistencia múltiple a antibióticos (IRMA) en aislamientos de E. coli y K. pneumoniae causantes de infección urinaria en pacientes con cáncer según el fenotipo BLEE 1.4. Justificación En la actualidad nos encontramos en un escenario preocupante: las bacterias han demostrado su enorme capacidad de mutación y de transmisión efectiva de la información entre ellas, logrando así niveles insospechados de resistencia a los antimicrobianos. Las infecciones del tracto urinario (ITU) constituyen una de las patologías infecciosas más frecuentes en la comunidad y en el ámbito hospitalario. Se estima que la incidencia mundial de ITU es de 2 a 3 casos por 100 habitantes al año, representando un problema clínico y de gran repercusión económica (Lifonzo-Mucha et al., 2018). Para el tratamiento de infecciones urinarias no complicadas, Fosfomicina tiene un amplio espectro de actividad contra bacterias Gram-positivos y Gram-negativos (Falagas et al., 2016). La Fosfomicina también muestra actividad in vitro contra patógenos MDR, 8 incluyendo K. pneumoniae resistente a carbapenémicos, Pseudomonas aeruginosa, bacterias productoras de BLEE y enterococos resistente a vancomicina. Sin embargo, los datos clínicos del uso de Fosfomicina para el tratamiento de las ITU debido a patógenos MDR son limitados (Falagas et al., 2010). En la actualidad no hay estudios sobre la sensibilidad in vitro de E. coli y K. pneumoniae productora de BLEE aislados de urocultivos frente a Fosfomicina en pacientes oncológicos con infecciones urinarias complicadas en Perú. El presente estudio nos permitirá evaluar de manera integral el potencial terapéutico de la Fosfomicina. Es importante hacer este tipo de estudios para poder saber cuál es el tratamiento empírico adecuado que se debe suministrar al paciente hasta contar con el resultado del urocultivo y antibiograma, así se podrá suministrar el tratamiento idóneo a la aparición de enterobacterias productoras de β-lactamasas de espectro extendido ya que están asociada a una mayor mortalidad sobre todo en pacientes oncológicos. 9 II. Marco Teórico La ITU es una de las infecciones asociadas a la atención de salud siendo más frecuente en áreas de pacientes críticos y fundamentalmente relacionada al uso de catéteres urinarios o instrumentalización de la vía urinaria (Durán, 2018; Flores-Mireles et al., 2015). La resistencia antimicrobiana es un problema global creciente, que también afecta a los agentes etiológicos comunes de las infecciones del tracto urinario (ITU) y puede implicar mayor morbimortalidad sin un tratamiento adecuado. Existen diferencias regionales en la resistencia a nivel ambulatorio versus nosocomial que deben considerarse (Durán, 2018). El abordaje principal para iniciar tratamiento en una ITU requiere la evaluación cuidadosa del paciente para estratificar la ITU en una de estas tres categorías: bacteriuria asintomática, ITU no complica, ITU complicada, ya que esta separación afectara en el alcance del tratamiento, la ubicación del tratamiento (paciente ambulatorio vs paciente internado), la selección y duración del tratamiento antimicrobiano (Mazzulli, 2012). 2.1. Bases Teóricas En los últimos años se ha producido un incremento de los aislamientos de cepas de E. coli y K. pneumoniae productoras de BLEE, posiblemente en relación con el uso generalizado de cefalosporinas de amplio espectro (de Cueto, Hernández, et al., 2006). Las BLEE son enzimas que algunas bacterias pueden producir. Los BLEE pueden hacer que algunos antibióticos sean ineficaces. Esto hace que la infección causada por esta bacteria sea mucho más difícil de tratar. Desde su aparición en 1983, las cepas productoras de BLEE se han considerado fundamentalmente como patógenos nosocomiales, sin embargo, actualmente las infecciones 10 por enterobacterias productoras de BLEE son un problema emergente en la comunidad (Ana Ma García-Hernández et al., 2011). La mortalidad en lo más severo de estas infecciones, particularmente las que progresan a la bacteriemia, llegan a un 60.8%. Las posibilidades de supervivencia aumentan con el uso apropiado, cobertura antibiótica inicial, mientras que la terapia a destiempo se asocia con un aumento de la mortalidad. La terapia antibiótica empírica, en el entorno ambulatorio, es problemática ya que la mayoría de estos organismos son resistentes a las fluoroquinolonas, trimetoprima/sulfametoxazol, cefalosporinas orales y amoxicilina/ clavulánico (Prakash et al., 2009). En países de Latino América la producción de BLEE fue de 9,7% en el caso de E. coli y 17,5% en K pneumoniae. Asimismo, se observó que K. pneumoniae tenía una mayor tasa de detección de BLEE. Una publicación más reciente que evaluó 2841 aislamientos de K. pneumoniae del periodo 2008 - 2009, encontró una resistencia global a ceftriaxona del 26% y determinó que el 22,4% de aislamientos eran productores de BLEE. La tasa más alta de producción de BLEE fue encontrada en aislamientos provenientes de América Latina (34,6%), comparado con Europa (19,7%) y Norte América (10%) (García et al., 2012). Actualmente la Fosfomicina es cada vez más necesaria para el tratamiento de microorganismos resistentes a múltiples fármacos (MDR) que causan infección del tracto urinario (ITU). Las Características que hacen que la Fosfomicina sea atractiva para el tratamiento de la ITU incluye la absorción rápida después de la administración oral, concentración para la excreción en la orina, actividad en biopelículas y su eficacia contra muchos organismos resistentes a múltiples fármacos, incluidos los productores de BLEE y productora de AmpC Enterobacteriaceae. La Fosfomicina oral es bien tolerada y en gran 11 parte libre de efectos adversos graves, solo el 5% de los pacientes informaron efectos secundarios, siendo la más común diarrea (Matthews et al., 2016). La Fosfomicina es un antibiótico bactericida de amplio espectro aislado por primera vez en 1969 a partir de cultivos de Streptomyces spp., su producción es actualmente mediante un proceso sintético, es un derivado de ácido fosfónico altamente polar de bajo peso molecular (138 g / mol) (Dijkmans et al., 2017). La Fosfomicina se comercializó inicialmente como una formulación de sal de calcio (Fosfomicina cálcica) para administración oral y una sal disódica más hidrófila (Fosfomicina disódica) para administración parenteral. Más tarde, debido a su biodisponibilidad mejorada, Fosfomicina trometamol se convirtió en la formulación estándar para la administración oral (Falagas et al., 2016). Las estructuras moleculares de las formulaciones de Fosfomicina son mostradas en la figura 1. Figura 1 Estructura molecular de la Fosfomicina Nota. (A) Fosfomicina trometamol. (B) Fosfomicina cálcica (C) Fosfomicina disódica (Falagas et al., 2016). 12 Debido a su bajo peso molecular, su larga vida media (2.4-7.3 horas) y su baja unión a proteínas plasmáticas, Fosfomicina difunde fácilmente en la mayoría de tejidos y en el líquido intersticial. Ha demostrado que penetra y alcanza concentraciones relevantes en tejidos inflamados, humor acuoso y vítreo, hueso y pulmón. El grado de penetración en tejidos parece ser mayor en tejido subcutáneo y músculo, seguido de pulmón y hueso. Aunque la Fosfomicina atraviesa la barrera hematoencefálica en pacientes con meningitis, su actividad puede verse reducida en líquido cefalorraquídeo (Aguilar, 2017). Entre los antimicrobianos recomendados para el tratamiento de la ITU no complicada de la comunidad, Fosfomicina trometamol se considera una alternativa de primera línea por su elevada actividad frente a los uropatógenos más frecuentes. Sin embargo, su actividad frente a cepas productoras de BLEE no es bien conocida (De Cueto Lopez et al., 2006). Un estudio realizado en Estados Unidos, la susceptibilidad a Fosfomicina fue alta, con 86% (38/44) de todos los aislados de MDR, 7% (3/44) intermedios, y 7% (3/44) resistente. La cura microbiológica ocurrió en el 59% (24/41) de los pacientes con ITU debido a un patógeno MDR. Para las K. pneumoniae carbapenemasa resistente, la tasa de curación microbiológica fue 46%. En general, la falla microbiológica ocurrió en el 41% (n = 17) de pacientes por recaída (n = 10) y reinfección (n = 7) dentro de los 30 días. Las tasas de curación microbiológica variaron según la susceptibilidad a Fosfomicina (Neuner et al., 2012). De Cueto et al. (2006) observaron en su estudio la excelente actividad in vitro de Fosfomicina contra cepas de E. coli y K. pneumoniae productoras de BLEE. Dado que la Fosfomicina solo está aprobada en los Estados Unidos para el tratamiento de ITU en E. coli, ellos sugieren realizar más estudios clínicos para evaluar la eficacia clínica de Fosfomicina 13 para el tratamiento de ITU causadas por K. pneumoniae productor de BLEE (De Cueto et al., 2006). 14 III. Método 3.1. Tipo de Investigación Hernández et al. (2010) definen la investigación como “un conjunto de procesos sistemáticos, críticos y empíricos que se aplican al estudio de un fenómeno” (Hernández et al., 2010). A lo largo de la historia de la ciencia han surgido diversas corrientes de pensamiento que han convergido en dos principales formas de indagar: el enfoque cuantitativo y el enfoque cualitativo de la investigación (Hernández et al., 2010). En el enfoque cuantitativo una característica que lo diferencia del enfoque cualitativo es la recolección de los datos. Esta se fundamenta en la medición de las variables o conceptos contenidos en las hipótesis. Esta recolección se lleva a cabo al utilizar procedimientos estandarizados y aceptados por una comunidad científica (Hernández et al., 2010). Como en este enfoque se pretende medir, los fenómenos estudiados deben poder observarse o referirse en el “mundo real” (Hernández et al., 2010). Debido a que los datos son producto de mediciones se representan mediante números (cantidades) y se deben analizar a través de métodos estadísticos. La investigación que se pretende realizar está basada en la medición de la respuesta biológica de microorganismo a la acción de antibióticos bajo condiciones estandarizadas, por lo tanto, esta investigación se ajusta al criterio del enfoque cuantitativo. En el diseño de un estudio, una característica central que permite la distinción entre prospectiva y retrospectivo es el orden en el tiempo de registro de la información de exposición y la ocurrencia de la enfermedad o evento de interés. Si la exposición es registrada después de la ocurrencia de la enfermedad, el estudio será retrospectivo (ejemplo: estudios de casos y controles), caso contrario el estudio será prospectivo (ejemplo: estudios de cohortes) (Rothman et al., 2008). Un estudio que incluye como sujetos a todas las personas 15 en la población en el momento de la determinación o una muestra representativa de todas esas personas, seleccionadas sin tener en cuenta la exposición o el estado de la enfermedad, generalmente se conoce como un estudio transversal (“Cross-sectional study”) (Rothman et al., 2008). El estudio realizado se ajusta a los criterios de un estudio transversal dado que las muestras de orina fueron analizadas y los patógenos aislados fueron evaluados con respecto a su susceptibilidad antibiótica sin establecer un orden temporal entre la exposición a algún factor de riesgo y el evento de interés. Adicionalmente a lo anterior todas las observaciones fueron únicas sin realizar ningún seguimiento de los pacientes o sus muestras en el tiempo o espacio. 3.2. Ámbito Temporal y Espacial El presente trabajo fue realizado en el Laboratorio de Microbiología del Instituto Nacional de Enfermedades Neoplásicas (Lima, Perú) durante el periodo 2017 - 2018. 3.3. Variables de Estudio Las variables de estudio son mostradas en la tabla 1. 16 Tabla 1 Variables de estudio Variable Tipo Escala Valores Cualitativa Sexo Nominal 1 = Hombre, 0 = Mujer dicotomica Cuantitativa Edad De razón 0 - 100 años continua Cualitativa Atención médica Nominal 1 = Ambulatoria, 2 = Hospitalización, 3 = Emergencia politómica Cualitativa Patógeno Nominal 1 = Escherichia coli, 0 = Klebsiella pneumoniae dicotómica Cualitativa BLEE Nominal 1 = Positivo, 0 = Negativo dicotómica Susceptibilidad Cualitativa Nominal 0 = Susceptible, 1 = Intermedio, 2 = Resistente antibiótica politómica Nota. BLEE, Producción de β-lactamasas de espectro extendido. 3.4. Población y Muestra La población de estudio estuvo conformada por todos los aislamientos de Escherichia coli y Klebsiella pneumoniae procedentes de muestras de orina que fueron recibidas en el Servicio de Microbiología del Instituto Nacional de Enfermedades Neoplásicas (INEN). La inclusión de los aislamientos fue de acuerdo al siguiente criterio:  Criterio de inclusión: (a) Aislamientos de E. coli y K. pneumoniae obtenidos de orina (104 a 105 UFC/ mL) de pacientes mayores de 18 años procedentes de los servicios de atención ambulatoria, hospitalización y emergencia. (b) Aislamientos 17 con prueba de susceptibilidad a Fosfomicina. Todos los aislamientos será incluidos indistintamente de la presencia o ausencia de la producción de -lactamasas 3.5. Instrumentos Los datos de las pruebas susceptibilidad antibiótica fueron tomados de los registros del servicio de Microbiología del Instituto Nacional de Enfermedades Neoplásicas (INEN). Se diseñó una ficha de recolección de datos (ver anexos) que fue usada para elaborar la correspondiente base de datos en formato digital usando el programa Microsoft EXCEL. 3.6. Procedimientos 3.6.1. Medios de cultivo y reactivos  Agar Mueller Hinton (MH), BDfi.  Agar Tripticasa de Soya (TSA), BDfi.  CHROMagar Orientation Medium BDfi.  Discos de Fosfomicina 200 μg conteniendo 50 μg de Glucosa-6-fosfato BD 3.6.2. Equipos  MALDI Biotyper CA System microflex. BRUKER.  Incubadora 35 - 37 ◦C, Binder.  BD PhoenixTM M50. BD Diagnostics, Inc.  Agitador de tipo vórtex. Thermo Fisher Scientific. 3.6.3. Otros  Frascos de 500 mL, tapa rosca autoclavables, Citotestfi.  Placas Petri de 90 x 15 mm, descartables y estériles, Samplefi.  Tubos de ensayo de 13 x 100 mm con tapa rosca. 18  Pipetas automáticas P1, P200 y P1000, Eppendorf.  Puntas para pipeta automática de 10, 100 y 100 μL. Eppendorf.  Asas estériles de 1 μL, Citotestfi. 3.6.4. Aislamiento de las cepas estudiadas Las muestras de orina fueron sembradas con un asa de siembra de 1 μL en agar sangre suplementado al 5% con sangre de carnero y BD CHROMagar Orientation Medium. Un recuento de 105 unidades formadoras de colonias por mililitro (UFC/mL) fue considerado como bacteriuria significativa, un recuento de >104 UFC/mL con un solo microorganismo más la presencia de > 40 leucocitos/mL fue considerado como bacteriuria positiva en orina no centrifugada y orinas con cultivos con crecimiento de 3 o más microorganismos fueron consideradas como contaminadas. Se aislaron e identificaron cepas de E. coli y K. pneumoniae de pacientes procedentes de los servicios de consultorio externo, hospitalización y emergencia. 3.6.5. Identificación de las cepas aisladas Las cepas de K. pneumoniae fueron identificadas por espectrometría de masas (MALDI Biotyper CA System) (Croxatto et al., 2012). MALDI-TOF MS (matrix assisted laser desorption ionization-time of flight-mass spectrometry, en español: desorción/ionización láser asistida por una matriz con detección de masas por tiempo de vuelo) ha permitido la utilización de la espectrometría de masas en la identificación de microorganismos mediante el análisis de proteínas, principalmente ribosomales, a través de la creación de un espectro de masas que es específico para cada género y especie (Maldonado et al., 2017; Patel, 2015). Es una técnica que existe hace más de 30 años. En los últimos años 19 han aparecido diversas plataformas comerciales que han permitido a los laboratorios de microbiología clínica acceder más fácilmente a esta tecnología. Figura 2 Espectrómetro de Masas MALDI-TOF Nota. La placa con las muestras es colocada en la cámara del espectrómetro de masas (Patel, 2015). Las cepas de E. coli fueron identificadas mediante CHROMagarTM Orientation Medium. Los medios cromogénicos son una alternativa aceptable a los medios tradicionales para el aislamiento de patógenos en orina (Manickam et al., 2013). Estos medios contienen sustratos cromogénicos que enzimas especificas hidrolizan generando productos coloreados visibles que permiten una fácil identificación de microorganismos específicos (Manickam et al., 2013; Perry & Freydière, 2007). 20 3.6.6. Determinación de la sensibilidad in vitro. 3.6.6.1. Prueba de susceptibilidad para E. coli y K. pneumoniae aisladas de muestras de orina usando el sistema automatizado de microbiología BD Phoenix ™ El sistema automatizado de microbiología BD Phoenix ™ (Becton-Dickinson Diagnostic Systems, Sparks, MD, USA), está diseñado para la identificación rápida in vitro y la determinación cuantitativa de la susceptibilidad antimicrobiana mediante una concentración inhibitoria mínima (CMI) para bacterias Gram negativas anaerobias, aeróbicas y facultativas que pertenecen o no a la familia Enterobacteriaceae. En el BD Phoenix ™ la prueba de susceptibilidad antibiótica llamada Phoenix AST (Antimicrobial susceptibility testing) es una versión miniaturizada modificada de la técnica de microdilución en caldo. Además, el BD Phoenix ™ utiliza un indicador redox para la detección del crecimiento del microorganismo en presencia de un agente antimicrobiano (Carroll et al., 2006). Mediciones continuas de los cambios en el indicador, así como la turbidez bacteriana, se utilizan en la determinación del crecimiento bacteriano. 3.6.6.2. Técnica de difusión en disco (Kirby-Bauer) para Fosfomicina La susceptibilidad antibiótica para Fosfomicina se realizó en agar Mueller-Hinton (MH) usando discos de Fosfomicina de 200 µg con 50 µg de Glucosa-6-fosfato según lo recomendado en las guías del Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI) (WEINSTEIN, 2018). La lectura de los halos de inhibición para los casos de colonias dentro de la zona de inhibición fue realizada siguiendo las instrucciones de la European Committee for Antimicrobial Susceptibility Testing (EUCAST: Clinical breakpoints, s. f.). 21 3.6.6.3. Interpretación de resultados según el diámetro de la zona de inhibición para Fosfomicina Según el CSLI los puntos de cortes recomendados fueron:  Susceptible: ≥ 16 mm.  Intermedio: 13 - 15 mm.  Resistente: ≤ 12 mm. 3.6.6.4. Control de calidad de los antibióticos Para el control de calidad de los discos de Fosfomicina 200 µg conteniendo 50 µg de glucosa-6-fosfato, se utilizarán cepas:  Escherichia coli ATCC 25922.  Staphylococcus aureus ATCC 25923. 3.6.6.5. Detección de Betalactamasas de Espectro Extendido (BLEE) La producción de BLEE fue detectada mediante el BD Phoenix ™ a través de la prueba Phoenix ESBL (Extended Spectrum Beta-Lactamases). Esta prueba se basa en la detección de crecimiento bacteriano en respuesta a cefalosporinas seleccionadas (cefpodoxima, ceftazidima, ceftriaxona y cefotaxima) con o sin ácido Clavulánico (figura 3). Los resultados se analizan con el sistema BDXpert integrado (versión 5.10ASR1) (Farber et al., 2008; Snyder et al., 2008). 22 Figura 3 Algoritmo de la Prueba Phoenix ESBL Nota. Abreviaturas: POS, crecimiento positivo en respuesta a un predeterminado umbral a las 6 horas; NEG, crecimiento negativo a un predeterminado umbral a las 6 horas (Sanguinetti et al., 2003). 3.6.7. Índice de resistencia a múltiples antibióticos (IRMA) La resistencia a antibióticos múltiples en bacterias se asocia más comúnmente con la presencia de plásmidos que contienen uno o más genes de resistencia, cada uno de los cuales codifica un solo fenotipo de resistencia a antibióticos (Osundiya et al., 2013). El índice de resistencia a múltiples antibióticos (IRMA) es útil para analizar el riesgo para la salud y se utiliza para verificar la resistencia a los antibióticos (Riaz et al., s. f.). El índice IRMA se calculó utilizando la fórmula a / b, en la cual, a es el número total de 23 antibióticos a los que el organismo era resistente, y b es el número total de antibióticos a los que se sometió el organismo a prueba (Bhuvaneshwari, 2017). El índice IRMA tiene un rango de 0 a 1, las bacterias que tienen un índice IRMA > 0.2 se originan a partir de una fuente de contaminación de alto riesgo donde los antibióticos se usan con mucha frecuencia (Bhuvaneshwari, 2017). 3.7. Análisis de Datos Los datos fueron resumidos usando tablas de frecuencia usando frecuencias absolutas y relativas. Las variables cuantitativas fueron resumidas usando mediana y cuartiles siendo graficadas usando el diagrama de cajas y bigotes. Los resultados de las pruebas de susceptibilidad antibiótica fueron graficados mediante la técnica multivariante denominada análisis de conglomerados jerárquico. Esta técnica estadística permite clasificar objetos formando grupos/conglomerados (clúster) que sean lo más homogéneos posible dentro de si mismos y heterogéneos entre sí. Todos los cálculos fueron realizados usando el programa libre R versión 3.6.1 (https://www.rproject.org/). 24 IV. Resultados 4.1. Número de Pruebas de Susceptibilidad Antibiótica realizadas para E. coli y K. pneumoniae en el Periodo de Estudio 2017 - 2018 En el Servicio de Microbiología, durante el periodo 2017 y 2018 fueron realizadas un total de 1419 pruebas de susceptibilidad que incluyeron al antibiótico Fosfomicina para E. coli y K. pneumoniae aisladas de muestras de orina de pacientes con cáncer (ver tabla 2). El 90.7 % (1164/1283) ha correspondido a E. coli o K. pneumoniae aislada de una única muestra de orina recibida por paciente en el periodo 2017 - 2018. El 9.3 % (119/1283) han correspondido a pruebas de susceptibilidad para E. coli o K. pneumoniae aislada de repetidas muestras de orina del mismo paciente durante el periodo 2017 – 2018. Tabla 2 Pruebas de susceptibilidad realizadas para aislamientos de E. coli y/o K. pneumoniae de muestras de orina de pacientes con cáncer en el periodo 2017 – 2018 en el Instituto Nacional de Enfermedades Neoplásicas (Lima – Perú) 25 4.2. Pruebas de Susceptibilidad Antibiótica para E. coli y K. pneumoniae Aisladas de Muestras de Orina según las Características Demográficas y Servicio de Procedencia de los Pacientes con Cáncer. El mayor porcentaje de pruebas de susceptibilidad antibióticas ha correspondido a aislamiento de E. coli procedentes de pacientes del género femenino (ver Tabla 3). En el año 2018 para K. pneumoniae las muestras procedentes de varones fueron las más frecuentes. Tabla 3 Pruebas de susceptibilidad antibiótica para Fosfomicina según el microorganismo causantes de infección urinaria y el género del paciente con cáncer. Instituto Nacional de Enfermedades Neoplásicas, periodo 2017 – 2018 (Lima – Perú). Con respecto a la edad de los pacientes cuyas muestras fueron remitidas al laboratorio de microbiología, los varones han mostrado una mayor mediana con respecto a las mujeres indistintamente del microorganismo causante de su infección urinaria (ver Figura 4). Los 26 pacientes con una infección por E. coli han tenido una tendencia a tener una edad mayor que aquellos con una infección por K. pneumoniae. Figura 4 Variación de la edad según género y microorganismo (E. coli o K. pneumoniae) causantes de infección urinaria en pacientes con cáncer. Instituto Nacional de Enfermedades Neoplásicas, periodo 2017 - 2018 (Lima – Perú). Nota. Los números dentro de las cajas indican la mediana. 27 En ambos periodos de observación el mayor porcentaje de cepas de E. coli analizadas corresponde a muestras de orina de pacientes atendidos a través de consultorio externos (ver Tabla 4). En la misma tabla puede observarse que los aislamientos de K. pneumoniae estuvieron asociados a hospitalización en el año 2017 y a consultorio externo en el año 2018. Tabla 4 Distribución de las pruebas de susceptibilidad antibiótica para E. coli y K. pneumoniae asociadas a infección urinaria según procedencia de los pacientes con cáncer. Instituto Nacional de Enfermedades Neoplásicas, periodo 2017 - 2018 (Lima – Perú). 28 4.3. Frecuencia del Fenotipo BLEE en Aislamiento de E. coli y K. pneumoniae Asociadas a Infección Urinaria en Pacientes con Cáncer Un alto porcentaje de las cepas evaluadas ha mostrado corresponder al fenotipo BLEE positivo (ver Tabla 5). En la misma tabla se puede observar que el fenotipo BLEE positivo a mostrado una frecuencia mayor en K. pneumoniae con respecto a E. coli en ambos periodos de estudio. Tabla 5 Fenotipo BLEE en aislamientos de E. coli y K. pneumoniae asociadas a infección urinaria en pacientes con cáncer. Instituto Nacional de Enfermedades Neoplásicas, periodo 2017 - 2018 (Lima–Perú). 29 Al categorizar la edad de los pacientes en dos grupos definida según si alcanzaron la edad de 65 años muestra que los aislamientos de E. coli o K. pneumoniae presentan el fenotipo BLEE positivo con mayor frecuencia en el grupo de edad mayor de 65 años (ver Tabla 6). Tabla 6 Frecuencia del fenotipo BLEE en E. coli y K. pneumoniae asociadas a infección urinaria en pacientes con cáncer según grupo etario. Instituto Nacional de Enfermedades Neoplásicas, periodo 2017 - 2018 (Lima–Perú). 30 Se observó una mayor frecuencia del fenotipo BLEE positivo en E. coli y K. pneumoniae asociada a pacientes con cáncer del género masculino (ver Tabla 7). En la misma tabla puede observarse que K. pneumoniae posee una mayor frecuencia del fenotipo BLEE + asociado al género masculino. Tabla 7 Variación de la frecuencia del fenotipo BLEE positivo en E. coli y K. pneumoniae asociadas a infección urinaria en pacientes con cáncer según género. Instituto Nacional de Enfermedades Neoplásicas, periodo 2017 - 2018 (Lima–Perú). 31 4.4. Actividad Inhibitoria de Fosfomicina (FOS) Frente a Aislamientos de E. coli y K. pneumoniae Causantes de Infección Urinaria en Pacientes con Cáncer. El patrón de susceptibilidad a Fosfomicina en aislamientos de E. coli muestra una alta actividad inhibitoria de esta droga sobre las variantes BLEE negativas (ver Tabla 8). En este grupo, un ligero incremento en la resistencia a la Fosfomicina se observa entre 2017 y 2018. En los aislamientos BLEE positivos se mantiene una alta actividad inhibitoria sin embargo hay un marcado incremento en los niveles de resistencia con respecto al grupo BLEE negativo. El patrón de susceptibilidad a Fosfomicina en aislamientos de K. pneumoniae muestra una alta actividad inhibitoria de esta droga sobre las variantes BLEE positivas y negativas. En el año 2018 K. pneumoniae ha mostrado un incremento en los niveles de resistencia con respecto al año 2017 siendo más acentuado en los aislamientos BLEE positivos. Globalmente el fenotipo BLEE positivo en E. coli causa un mayor incremento en los niveles de resistencia Fosfomicina que los observados en K. pneumoniae. 32 Tabla 8 Patrón de susceptibilidad antibiótica de E. coli y K. pneumoniae asociadas a infección urinaria en pacientes con cáncer frente a Fosfomicina según la presencia o ausencia del fenotipo BLEE. Instituto Nacional de Enfermedades Neoplásicas, periodo 2017 - 2018 (Lima–Perú). 33 4.5. Actividad inhibitoria de los aminoglucósidos Gentamicina (GEN) y Amikacina (AMK) frente a aislamientos de E. coli y K. pneumoniae causantes de infección urinaria en pacientes con cáncer. En el grupo de los aminoglucósidos Gentamicina y Amikacina muestran una marcada diferencia en la actividad inhibitoria frente a la presencia del fenotipo BLEE positivo (ver tablas 9 y 10). Los aislamientos de E. coli BLEE negativo evaluados con Gentamicina han mostrado una frecuencia de resistencia máxima de 14.1 % correspondiente al año 2017. En E. coli BLEE positivo la frecuencia de resistencia máxima fue 50.4 % correspondiente al año 2018. Considerando el total de E. coli evaluadas la frecuencia de resistencia fue 49.4 y 13.9 % para el fenotipo BLEE positivo y negativo respectivamente. Los aislamientos de K. pneumoniae BLEE negativo evaluados con Gentamicina han mostrado una frecuencia de resistencia máxima de 7.9 % correspondiente al año 2018. En K. pneumoniae BLEE positivo la frecuencia de resistencia máxima fue 55.4 % correspondiente al año 2018. Considerando el total de K. pneumoniae evaluadas la frecuencia de resistencia fue 55.1 y 6.1 % para el fenotipo BLEE positivo y negativo respectivamente. Los aislamientos de E. coli BLEE negativo evaluados con Amikacina han mostrado una frecuencia de resistencia máxima de 0.4 % correspondiente al año 2017. En E. coli BLEE positivo la frecuencia de resistencia máxima fue 1.8 % correspondiente al año 2018. Considerando el total de E. coli evaluadas la frecuencia de resistencia fue 1.6 y 0.2 % para el fenotipo BLEE positivo y negativo respectivamente. Los aislamientos de K. pneumoniae BLEE negativo evaluados con Amikacina han mostrado una frecuencia de resistencia de 0 % en ambos años de evaluación. En K. pneumoniae BLEE positivo la frecuencia de 34 resistencia máxima fue 3.6 % correspondiente al año 2018. Considerando el total de K. pneumoniae evaluadas la frecuencia de resistencia fue 2.8 y 0 % para el fenotipo BLEE positivo y negativo respectivamente. 35 Tabla 9 Patrón de susceptibilidad antibiótica de E. coli y K. pneumoniae asociadas a infección urinaria en pacientes con cáncer frente a Gentamicina según la presencia o ausencia del fenotipo BLEE. Instituto Nacional de Enfermedades Neoplásicas, periodo 2017 - 2018 (Lima–Perú). 36 Tabla 10 Patrón de susceptibilidad antibiótica de E. coli y K. pneumoniae asociadas a infección urinaria en pacientes con cáncer frente a Amikacina según la presencia o ausencia del fenotipo BLEE. Instituto Nacional de Enfermedades Neoplásicas, periodo 2017 - 2018 (Lima–Perú). 37 4.6. Actividad Inhibitoria de las Quinolonas, Ciprofloxacino (CIP) y Norfloxacino (NOR), Frente a Aislamientos de E. coli y K. pneumoniae Causantes de Infección Urinaria en Pacientes con Cáncer. En el grupo de las quinolonas Ciprofloxacino y Norfloxacino muestran una escasa actividad bactericida (ver tablas 11 y 12). Los aislamientos de E. coli BLEE negativo evaluados con Ciprofloxacino han mostrado una frecuencia de resistencia máxima de 49.6 % correspondiente al año 2017. En E. coli BLEE positivo la frecuencia de resistencia máxima fue 95.4 % correspondiente al año 2017. Considerando el total de E. coli evaluadas la frecuencia de resistencia fue 93.9 y 49.4 % para el fenotipo BLEE positivo y negativo respectivamente. Los aislamientos de K. pneumoniae BLEE negativo evaluados con Ciprofloxacino han mostrado una frecuencia de resistencia máxima de 34.2 % correspondiente al año 2018. En K. pneumoniae BLEE positivo la frecuencia de resistencia máxima fue 78.3 % correspondiente al año 2018. Considerando el total de K. pneumoniae evaluadas la frecuencia de resistencia fue 76.6 y 32.7 % para el fenotipo BLEE positivo y negativo respectivamente. Los aislamientos de E. coli BLEE negativo evaluados con Norfloxacino han mostrado una frecuencia de resistencia máxima de 49.8 % correspondiente al año 2017. En E. coli BLEE positivo la frecuencia de resistencia máxima fue 93.3 % correspondiente al año 2017. Considerando el total de E. coli evaluadas la frecuencia de resistencia fue 92.9 y 49.5 % para el fenotipo BLEE positivo y negativo respectivamente. Los aislamientos de K. pneumoniae BLEE negativo evaluados con Norfloxacino han mostrado una frecuencia de resistencia máxima de 36.4 % correspondiente al año 2017. En K. pneumoniae BLEE positivo la frecuencia de resistencia máxima fue 72.3 % correspondiente al año 2018. Considerando el 38 total de K. pneumoniae evaluadas la frecuencia de resistencia fue 71.0 y 34.7 % para el fenotipo BLEE positivo y negativo respectivamente. 39 Tabla 11 Patrón de susceptibilidad antibiótica de E. coli y K. pneumoniae asociadas a infección urinaria en pacientes con cáncer frente a Ciprofloxacino según la presencia o ausencia del fenotipo BLEE. Instituto Nacional de Enfermedades Neoplásicas, periodo 2017 - 2018 (Lima–Perú). 40 Tabla 12 Patrón de susceptibilidad antibiótica de E. coli y K. pneumoniae asociadas a infección urinaria en pacientes con cáncer frente a Norfloxacino según la presencia o ausencia del fenotipo BLEE. Instituto Nacional de Enfermedades Neoplásicas, periodo 2017 - 2018 (Lima–Perú). 41 4.7. Actividad Inhibitoria de los Carbapenems, Imipenem (IPM), Meropenem (MEM) y Ertapenem (ETP), Frente a Aislamientos de E. coli y K. pneumoniae Causantes de Infección Urinaria en Pacientes con Cáncer. En el grupo de los carbapenems Imipenem, Meropenem y Ertapenem muestran una alta actividad bactericida (ver tablas 13, 14 y 15). Los aislamientos de E. coli BLEE negativo evaluados con Imipenem han mostrado una frecuencia de resistencia de 0 % para ambos años. En E. coli BLEE positivo la frecuencia de resistencia máxima fue 0.4 % correspondiente al año 2017. Considerando el total de E. coli evaluadas la frecuencia de resistencia fue 0.2 y 0 % para el fenotipo BLEE positivo y negativo respectivamente. Los aislamientos de K. pneumoniae BLEE negativo evaluados con Imipenem han mostrado una frecuencia de resistencia de 0 % para ambos años. En K. pneumoniae BLEE positivo la frecuencia de resistencia máxima fue 8.4 % correspondiente al año 2018. Considerando el total de K. pneumoniae evaluadas la frecuencia de resistencia fue 8.4 y 0 % para el fenotipo BLEE positivo y negativo respectivamente. El efecto bactericida de Meropenem ha sido idéntico al observado con Imipenem. Los aislamientos de E. coli BLEE negativo evaluados con Ertapenem han mostrado una frecuencia de resistencia de 0 % para ambos años. En E. coli BLEE positivo la frecuencia de resistencia máxima fue 5.7 % correspondiente al año 2018. Considerando el total de E. coli evaluadas la frecuencia de resistencia fue 2.7 y 0 % para el fenotipo BLEE positivo y negativo respectivamente. Los aislamientos de K. pneumoniae BLEE negativo evaluados con Imipenem han mostrado una frecuencia de resistencia de 5.3 % correspondiente al año 2018. En K. pneumoniae BLEE positivo la frecuencia de resistencia máxima fue 19.3 % 42 correspondiente al año 2018. Considerando el total de K. pneumoniae evaluadas la frecuencia de resistencia fue 16.8 y 4.1 % para el fenotipo BLEE positivo y negativo respectivamente. 43 Tabla 13 Patrón de susceptibilidad antibiótica de E. coli y K. pneumoniae asociadas a infección urinaria en pacientes con cáncer frente a Imipenem según la presencia o ausencia del fenotipo BLEE. Instituto Nacional de Enfermedades Neoplásicas, periodo 2017 - 2018 (Lima–Perú). 44 Tabla 14 Patrón de susceptibilidad antibiótica de E. coli y K. pneumoniae asociadas a infección urinaria en pacientes con cáncer frente a Meropenem según la presencia o ausencia del fenotipo BLEE. Instituto Nacional de Enfermedades Neoplásicas, periodo 2017 - 2018 (Lima–Perú). 45 Tabla 15 Patrón de susceptibilidad antibiótica de E. coli y K. pneumoniae asociadas a infección urinaria en pacientes con cáncer frente a Ertapenem según la presencia o ausencia del fenotipo BLEE. Instituto Nacional de Enfermedades Neoplásicas, periodo 2017 - 2018 (Lima–Perú). 46 4.8. Actividad Inhibitoria de los Betalactámicos Piperacilina/tazobactam (TZP) y Amoxicilina-Ácido Clavulánico (AMC) Frente a Aislamientos de E. coli y K. pneumoniae Causantes de Infección Urinaria en Pacientes con Cáncer. En el grupo de los betalactámicos Piperacilina/tazobactam y Amoxicilina-ácido clavulánico muestran una diferenciada actividad bactericida (ver tablas 16 y 17). Los aislamientos de E. coli BLEE negativo evaluados con Piperacilina/tazobactam han mostrado una frecuencia de resistencia máxima de 2.3 % correspondiente al año 2017. En E. coli BLEE positivo la frecuencia de resistencia máxima fue 3.9 % correspondiente al año 2017. Considerando el total de E. coli evaluadas la frecuencia de resistencia fue 3.5 y 1.8 % para el fenotipo BLEE positivo y negativo respectivamente. Los aislamientos de K. pneumoniae BLEE negativo evaluados con Piperacilina/tazobactam han mostrado una frecuencia de resistencia máxima de 2.6 % correspondiente al año 2018. En K. pneumoniae BLEE positivo la frecuencia de resistencia máxima fue 25.3 % correspondiente al año 2018. Considerando el total de K. pneumoniae evaluadas la frecuencia de resistencia fue 23.4 y 2.0 % para el fenotipo BLEE positivo y negativo respectivamente. Los aislamientos de E. coli BLEE negativo evaluados con Amoxicilina-ácido clavulánico han mostrado una frecuencia de resistencia máxima de 7.7 % correspondiente al año 2018. En E. coli BLEE positivo la frecuencia de resistencia fue 100 % para ambos años. Considerando el total de E. coli evaluadas la frecuencia de resistencia fue 100 y 6.4 % para el fenotipo BLEE positivo y negativo respectivamente. Los aislamientos de K. pneumoniae BLEE negativo evaluados con Amoxicilina-ácido clavulánico han mostrado una frecuencia de resistencia máxima de 26.3 % correspondiente al año 2018. En K. pneumoniae BLEE positivo la frecuencia de resistencia fue 100 % correspondiente para ambos años. 47 Considerando el total de K. pneumoniae evaluadas la frecuencia de resistencia fue 100 y 20.4 % para el fenotipo BLEE positivo y negativo respectivamente. 48 Tabla 16 Patrón de susceptibilidad antibiótica de E. coli y K. pneumoniae asociadas a infección urinaria en pacientes con cáncer frente a Piperacilina/tazobactam según la presencia o ausencia del fenotipo BLEE. Instituto Nacional de Enfermedades Neoplásicas, periodo 2017 - 2018 (Lima–Perú). 49 Tabla 17 Patrón de susceptibilidad antibiótica de E. coli y K. pneumoniae asociadas a infección urinaria en pacientes con cáncer frente a Amoxicilina-ácido clavulánico según la presencia o ausencia del fenotipo BLEE. Instituto Nacional de Enfermedades Neoplásicas, periodo 2017 - 2018 (Lima–Perú). 50 4.9. Actividad Inhibitoria de la Cefalosporina Cefazolina (CZO) Frente a Aislamientos de E. coli y K. pneumoniae Causantes de Infección Urinaria en Pacientes con Cáncer. En el grupo de los betalactámicos la cefalosporina Cefazolina los aislamientos evaluados muestran una alta frecuencia de resistencia (ver tabla 18). Los aislamientos de E. coli BLEE negativo evaluados con Cefazolina han mostrado una frecuencia de resistencia máxima de 5.7 % correspondiente al año 2017. En E. coli BLEE positivo la frecuencia de resistencia fue 100 % para ambos años. Considerando el total de E. coli evaluadas la frecuencia de resistencia fue 100 y 4.4 % para el fenotipo BLEE positivo y negativo respectivamente. Los aislamientos de K. pneumoniae BLEE negativo evaluados con Cefazolina han mostrado una frecuencia de resistencia máxima de 5.3 % correspondiente al año 2018. En K. pneumoniae BLEE positivo la frecuencia de resistencia máxima fue 100 % correspondiente a ambos años. Considerando el total de K. pneumoniae evaluadas la frecuencia de resistencia fue 100 y 4.1 % para el fenotipo BLEE positivo y negativo respectivamente. 51 Tabla 18 Patrón de susceptibilidad antibiótica de E. coli y K. pneumoniae asociadas a infección urinaria en pacientes con cáncer frente a Cefazolina según la presencia o ausencia del fenotipo BLEE. Instituto Nacional de Enfermedades Neoplásicas, periodo 2017 - 2018 (Lima–Perú). 52 4.10. Actividad Inhibitoria del Trimetoprim / Sulfametoxazol (SXT) y Nitrofurantoina (NIT) Frente a Aislamientos de E. coli y K. pneumoniae Causantes de Infección Urinaria en Pacientes con Cáncer. En el grupo de las sulfonamidas y nitrofuranos, la evaluación con Trimetoprim / Sulfametoxazol y Nitrofurantoina muestra que los aislamientos evaluados exhiben una mayor frecuencia de resistencia en presencia del fenotipo BLEE positivo (ver tablas 19 y 20). Los aislamientos de E. coli BLEE negativo evaluados con Trimetoprim / Sulfametoxazol han mostrado una frecuencia de resistencia máxima de 57.7 % correspondiente al año 2018. En E. coli BLEE positivo la frecuencia de resistencia máxima fue 78.1 % correspondiente al año 2018. Considerando el total de E. coli evaluadas la frecuencia de resistencia fue 77.3 y 56.2 % para el fenotipo BLEE positivo y negativo respectivamente. Los aislamientos de K. pneumoniae BLEE negativo evaluados con Trimetoprim / Sulfametoxazol han mostrado una frecuencia de resistencia máxima de 36.4 % correspondiente al año 2017. En K. pneumoniae BLEE positivo la frecuencia de resistencia máxima fue 91.7 % correspondiente al año 2017. Considerando el total de K. pneumoniae evaluadas la frecuencia de resistencia fue 88.8 y 32.7 % para el fenotipo BLEE positivo y negativo respectivamente. Los aislamientos de E. coli BLEE negativo evaluados con Nitrofurantoina han mostrado una frecuencia de resistencia máxima de 3.0 % correspondiente al año 2017. En E. coli BLEE positivo la frecuencia de resistencia máxima fue 4.6 % correspondiente al año 2017. Considerando el total de E. coli evaluadas la frecuencia de resistencia fue 4.3 y 2.6 % para el fenotipo BLEE positivo y negativo respectivamente. Los aislamientos de K. 53 pneumoniae BLEE negativo evaluados con Nitrofurantoina han mostrado una frecuencia de resistencia máxima de 45.5 % correspondiente al año 2017. En K. pneumoniae BLEE positivo la frecuencia de resistencia máxima fue 45.8 % correspondiente al año 2018. Considerando el total de K. pneumoniae evaluadas la frecuencia de resistencia fue 41.1 y 24.5 % para el fenotipo BLEE positivo y negativo respectivamente. 54 Tabla 19 Patrón de susceptibilidad antibiótica de E. coli y K. pneumoniae asociada a infección urinaria en pacientes con cáncer frente a Trimetoprim/Sulfametoxazol según la presencia o ausencia del fenotipo BLEE. Instituto Nacional de Enfermedades Neoplásicas, periodo 2017 - 2018 (Lima–Perú). 55 Tabla 20 Patrón de susceptibilidad antibiótica de E. coli y K. pneumoniae asociada a infección urinaria en pacientes con cáncer frente a Nitrofurantoina según la presencia o ausencia del fenotipo BLEE. Instituto Nacional de Enfermedades Neoplásicas, periodo 2017 - 2018 (Lima–Perú). 56 4.11. Actividad Inhibitoria de las Cefalosporinas Ceftazidima, Ceftriaxona y Cefepima Frente a Aislamientos de E. coli y K. pneumoniae Causantes de Infección Urinaria en Pacientes con Cáncer. En el grupo de las cefalosporinas de tercera generación, la evaluación con Ceftazidima y Ceftriaxona muestra que los aislamientos evaluados exhiben una alta frecuencia de resistencia en presencia del fenotipo BLEE positivo y una ausencia de resistencia cuando dicho fenotipo está ausente (ver tablas 21, 22 y 23). En E. coli BLEE positivo la frecuencia de resistencia máxima a Ceftazidima fue 84.4 % correspondiente al año 2017. Considerando el total de E. coli BLEE positivo evaluadas la frecuencia de resistencia fue 83.4 %. En K. pneumoniae BLEE positivo la frecuencia de resistencia máxima fue 98.8 % correspondiente al año 2018. Considerando el total de K. pneumoniae BLEE positivo evaluadas la frecuencia de resistencia fue 96.3 %. En E. coli BLEE positivo la frecuencia de resistencia máxima a Ceftriaxona fue 100 % correspondiente al año 2018. Considerando el total de E. coli BLEE positivo evaluadas la frecuencia de resistencia fue 99.8 %. En K. pneumoniae BLEE positivo la frecuencia de resistencia máxima fue 100 % para ambos años. Con respecto a la cefalosporina de cuarta generación Cefepima a lo observado con las cefalosporinas de tercera generación. En E. coli BLEE positivo la frecuencia de resistencia máxima a Cefepima fue 73.7 % correspondiente al año 2018. Considerando el total de E. coli BLEE positivo evaluadas la frecuencia de resistencia fue 72.7 %. En K. pneumoniae BLEE positivo la frecuencia de resistencia máxima a Cefepima fue 95.8 % correspondiente al año 2017. Considerando el total de K. pneumoniae BLEE positivo evaluadas la frecuencia de resistencia a Cefepima fue 88.8%. 57 Tabla 21 Patrón de susceptibilidad antibiótica de E. coli y K. pneumoniae asociada a infección urinaria en pacientes con cáncer frente a Cefepima según la presencia o ausencia del fenotipo BLEE. Instituto Nacional de Enfermedades Neoplásicas, periodo 2017 - 2018 (Lima–Perú). 58 Tabla 22 Patrón de susceptibilidad antibiótica de E. coli y K. pneumoniae asociada a infección urinaria en pacientes con cáncer frente a Ceftazidima según la presencia o ausencia del fenotipo BLEE. Instituto Nacional de Enfermedades Neoplásicas, periodo 2017 - 2018 (Lima–Perú). 59 Tabla 23 Patrón de susceptibilidad antibiótica de E. coli y K. pneumoniae asociada a infección urinaria en pacientes con cáncer frente a Ceftazidima según la presencia o ausencia del fenotipo BLEE. Instituto Nacional de Enfermedades Neoplásicas, periodo 2017 - 2018 (Lima–Perú). 60 4.12. Análisis de Conglomerados Jerárquicos de los Patrones de Susceptibilidad Antibiótica en Aislamientos de E. coli y K. pneumoniae Causantes de Infección Urinaria en Pacientes con Cáncer. a) E. coli El análisis de conglomerados jerárquico de los resultados de las pruebas de susceptibilidad a antibióticos en aislamientos de E. coli BLEE negativas causantes de infección urinaria en pacientes con cáncer ha mostrado un agrupamiento que define dos conglomerados (ver figura 5). El primer conglomerado incluiría a los antibióticos Ciprofloxacino , Norfloxacino y Trimetoprim/Sulfametoxazol caracterizados por una mayor frecuencia de aislamientos resistentes. La Fosfomicina se encuentra en el conglomerado de antibióticos de mayor actividad. Dentro del grupo de antibióticos de mayor actividad inhibitoria, los carbapenems se distinguen del resto de antibióticos. El análisis de conglomerados en los aislamientos de E. coli BLEE positivos muestra también un agrupamiento que define dos conglomerados (ver figura 6). El primer conglomerado incluye a los antibióticos Ciprofloxacino, Norfloxacino, Trimetoprim/Sulfametoxazol, Amoxicilina-ácido Clavulánico y Cefazolina caracterizados por una mayor frecuencia de aislamientos resistentes. Dentro de los antibióticos con menor actividad inhibitoria Amoxicilina-ácido Clavulánico y Cefazolina tienen una nula actividad sobre E. coli BLEE positiva. La Fosfomicina se vuelve a ubicar en el grupo de antibióticos con mayor actividad. Dentro del grupo de antibióticos de mayor actividad inhibitoria, los carbapenems Imipenem y Meropenem se distinguen del resto de antibióticos. 61 Figura 5 Análisis de conglomerados jerárquico de los resultados de las pruebas de susceptibilidad a antibióticos en aislamientos de E. coli BLEE negativas causantes de infección urinaria en pacientes con cáncer. Instituto Nacional de Enfermedades Neoplásicas, periodo 2017 - 2018 (Lima–Perú). Nota. En rojo, aislamientos resistentes; blanco, aislamientos con resistencia intermedia y en azul, aislamientos susceptibles. Cefepima (FEP), Ceftazidima (CAZ), Ertapenem (ETP), Imipenem (IPM), Meropenem (MEM), Ceftriaxona (CRO), Amikacina (AMK), Piperacilina/tazobactam (TZP), Nitrofurantoina (NIT), Cefazolina (CZO), Fosfomicina (FOS), Amoxicilina-ácido clavulánico (AMC), Gentamicina (GEN), Ciprofloxacino (CIP), Norfloxacino (NOR) y Trimetoprim / Sulfametoxazol (SXT). 62 Figura 6 Análisis de conglomerados jerárquico de los resultados de las pruebas de susceptibilidad a antibióticos en aislamientos de E. coli BLEE positivas causantes de infección urinaria en pacientes con cáncer. Instituto Nacional de Enfermedades Neoplásicas, periodo 2017 - 2018 (Lima–Perú). Nota. En rojo, aislamientos resistentes; blanco, aislamientos con resistencia intermedia y en azul, aislamientos susceptibles. Cefepima (FEP), Ceftazidima (CAZ), Ertapenem (ETP), Imipenem (IPM), Meropenem (MEM), Ceftriaxona (CRO), Amikacina (AMK), Piperacilina/tazobactam (TZP), Nitrofurantoina (NIT), Cefazolina (CZO), Fosfomicina (FOS), Amoxicilina-ácido clavulánico (AMC), Gentamicina (GEN), Ciprofloxacino (CIP), Norfloxacino (NOR) y Trimetoprim / Sulfametoxazol (SXT). 63 b) K. pneumoniae El análisis de conglomerados jerárquico de los resultados de las pruebas de susceptibilidad a antibióticos en aislamientos de K. pneumoniae BLEE negativas causantes de infección urinaria en pacientes con cáncer ha mostrado un agrupamiento que define dos conglomerados (ver figura 7). El primer conglomerado incluiría a los antibióticos Ciprofloxacino, Norfloxacino, Trimetoprim/Sulfametoxazol y Nitrofurantoina caracterizados por una mayor frecuencia de aislamientos resistentes y resitencia intermedia. La Fosfomicina se encuentra en el conglomerado de antibióticos de mayor actividad. Dentro del grupo de antibióticos de mayor actividad inhibitoria, los carbapenems se distinguen del resto de antibióticos. El análisis de conglomerados en los aislamientos de K. pneumoniae BLEE positivos muestra también un agrupamiento que define dos conglomerados (ver figura 8). El primer conglomerado incluye a los antibioticos Gentamicina, Nitrofurantoina, Ciprofloxacino , Norfloxacino, Trimetoprim/Sulfametoxazol, Amoxicilina-ácido Clavulánico y Cefazolina caracterizados por una mayor frecuencia de aislamientos resistentes. Dentro de los antibioticos con menor actividad inhibitoria Amoxicilina-ácido Clavulánico y Cefazolina tienen una nula actividad sobre E. coli BLEE positiva. La Fosfomicina se vuelve a ubicar en el grupo de antibioticos con mayor actividad. Dentro del grupo de antibioticos de mayor actividad inhibitoria, los carbapenems Imipenem y Meropenem se distinguen del resto de antibioticos. 64 Figura 7 Análisis de conglomerados jerárquico de los resultados de las pruebas de susceptibilidad a antibióticos en aislamientos de K. pneumoniae BLEE negativas causantes de infección urinaria en pacientes con cáncer. Instituto Nacional de Enfermedades Neoplásicas, periodo 2017 - 2018 (Lima–Perú). Nota. En rojo, aislamientos resistentes; blanco, aislamientos con resistencia intermedia y en azul, aislamientos susceptibles. Cefepima (FEP), Ceftazidima (CAZ), Ertapenem (ETP), Imipenem (IPM), Meropenem (MEM), Ceftriaxona (CRO), Amikacina (AMK), Piperacilina/tazobactam (TZP), Nitrofurantoina (NIT), Cefazolina (CZO), Fosfomicina (FOS), Amoxicilina-ácido clavulánico (AMC), Gentamicina (GEN), Ciprofloxacino (CIP), Norfloxacino (NOR) y Trimetoprim / Sulfametoxazol (SXT). 65 Figura 8 Análisis de conglomerados jerárquico de los resultados de las pruebas de susceptibilidad a antibióticos en aislamientos de K. pneumoniae BLEE positivas causantes de infección urinaria en pacientes con cáncer. Instituto Nacional de Enfermedades Neoplásicas, periodo 2017 - 2018 (Lima–Perú). Nota. En rojo, aislamientos resistentes; blanco, aislamientos con resistencia intermedia y en azul, aislamientos susceptibles. Cefepima (FEP), Ceftazidima (CAZ), Ertapenem (ETP), Imipenem (IPM), Meropenem (MEM), Ceftriaxona (CRO), Amikacina (AMK), Piperacilina/tazobactam (TZP), Nitrofurantoina (NIT), Cefazolina (CZO), Fosfomicina (FOS), Amoxicilina-ácido clavulánico (AMC), Gentamicina (GEN), Ciprofloxacino (CIP), Norfloxacino (NOR) y Trimetoprim / Sulfametoxazol (SXT). 66 4.13. Indice de Resistencia Múltiple a Antibióticos (IRMA) en Aislamientos de E. coli y K. pneumoniae Causantes de Infección Urinaria en Pacientes con Cáncer según el Fenotipo BLEE Las figuras 9-12 muestra que la frecuencia de aislamientos de E. coli y K. pneumoniae según el fenotipo BLEE y el IRMA. Para los aislamientos de E. coli BLEE positivas, el indice IRMA tuvo un rango de 0.25 a 0.94, indicando que el 100 % de los aislamientos proceden de ambientes de riesgo con alta presión selectiva. La mediana de IRMA para este grupo fue de 0.5, indicando que en promedio los aislamiento fueron resistentes al 50 % de los antibióticos evaluados. Para los aislamientos de E. coli BLEE negativa, el indice IRMA tuvo un rango de 0 a 0.5, mostrando que 73 de las 498 aislamientos (14.7 %) proceden de ambientes de riesgo. La mediana de IRMA para este grupo fue 0.125, indicando que el 12.5 % de los aislamientos proceden de ambientes de riesgo. Para los aislamientos de K. pneumoniae BLEE positivas, el indice IRMA tuvo un rango de 0.25 a 0.875, indicando que el 100 % de los aislamientos proceden de ambientes de riesgo con alta presión selectiva. La mediana de IRMA para este grupo fue 0.56. Para los aislamientos de K. pneumoniae BLEE negativo, el indice IRMA tuvo un rango 0 a 0.438 y una mediana de 0.0625. Para este grupo 10 de 49 aislamientos (20.4 %) proceden de ambientes de riesgo. 67 Figura 9 Índice de Resistencia a Múltiples Antibióticos (IRMA) en aislamientos de E. coli BLEE positiva causantes de infección urinaria en pacientes con cáncer. Instituto Nacional de Enfermedades Neoplásicas, periodo 2017 - 2018 (Lima–Perú). Nota. Las bacterias que tienen un índice IRMA > 0.2 se originan en una fuente de alto riesgo donde se usan varios antibióticos. La línea punteada indica el punto de corte de IRMA. 68 Figura 10 Índice de Resistencia a Múltiples Antibióticos (IRMA) en aislamientos de E. coli BLEE negativa causantes de infección urinaria en pacientes con cáncer. Instituto Nacional de Enfermedades Neoplásicas, periodo 2017 - 2018 (Lima–Perú). Nota. Las bacterias que tienen un índice IRMA > 0.2 se originan en una fuente de alto riesgo donde se usan varios antibióticos. La línea punteada indica el punto de corte de IRMA. 69 Figura 11 Índice de Resistencia a Múltiples Antibióticos (IRMA) en aislamientos de K. pneumoniae BLEE positiva causantes de infección urinaria en pacientes con cáncer. Instituto Nacional de Enfermedades Neoplásicas, periodo 2017 - 2018 (Lima–Perú). Nota. Las bacterias que tienen un índice IRMA > 0.2 se originan en una fuente de alto riesgo donde se usan varios antibióticos. La línea punteada indica el punto de corte de IRMA. 70 Figura 12 Índice de Resistencia a Múltiples Antibióticos (IRMA) en aislamientos de K. pneumoniae BLEE negativa causantes de infección urinaria en pacientes con cáncer. Instituto Nacional de Enfermedades Neoplásicas, periodo 2017 - 2018 (Lima–Perú). Nota. Las bacterias que tienen un índice IRMA > 0.2 se originan en una fuente de alto riesgo donde se usan varios antibióticos. La línea punteada indica el punto de corte de IRMA. 71 V. Discusión de resultados Las infecciones del tracto urinario (ITU) representan un importante problema de salud pública, siendo las infecciones más frecuentemente encontradas en la comunidad (Sivick & Mobley, 2010). Se estima que cerca de 40% de las mujeres y el 12% de los hombres tendrán al menos un caso de ITU durante su vida adulta (Foxman, s.f.). Las ITU se asocia con altas tasas de recurrencia y, sin un manejo adecuado con antibiótico, puede progresar rápidamente a sepsis severa y muerte (Suárez et al., 2005). En pacientes con cáncer, inmunocomprometidos, la infección del tracto urinario (ITU) es una de las principales causas de fiebre y morbilidad (Parikh & Bhat, 2015). Con respecto a las infecciones urinarias en pacientes con cáncer Grasa y col. (2004) indican: “Las consultas en urgencias por motivos urológicos son relativamente frecuentes en el paciente oncológico en general, no siendo exclusiva su incidencia en pacientes afectos de neoplasias del aparato uro-genital” (Grasa et al., 2004). En pacientes oncológicos y no-oncológicos las infecciones de las vías urinarias está asociada a la presencia de bacilos Gram negativos, siendo E. coli el microorganismo aislado con mayor frecuencia (Flores-Mireles et al., 2015; Grasa et al., 2004). En el presente estudio E. coli y K. pneumoniae fueron analizados por ser los microorganismos con una mayor frecuencia de aislamiento en muestras de orina de pacientes con cáncer en el Laboratorio de Microbiología del INEN. Los pacientes con cáncer del presente estudio, tienen una frecuencia de ITU causadas por E. coli caracterizada por ser mayor en mujeres en comparación con los varones. Este patrón es similar al observado en pacientes no oncológicos de la comunidad. Sin embargo, las ITU causadas por K. pneumoniae en la muestra de estudio tiene una inversión de las frecuencias siendo los varones los más afectados, aunque la diferencia porcentual no es tan 72 amplia como las ITU causadas por E. coli. Dado que la mayoría de las ITU por Klebsiella spp. son infecciones nosocomiales asociadas al uso del catéter esto puede generar un riesgo de infección casi similar entre hombres y mujeres (Stahlhut et al., 2012). Esto podría estar relacionado con la alta frecuencia de cáncer de próstata que se reporta en varones con respecto al total de tipos de cáncer, siendo este tipo de cáncer frecuente en el uso de catéter y por lo tanto podría condicionar a los pacientes a una infección por K. pneumoniae (Luna- Abanto & Payet, 2019). En el presente estudio se incluyó la edad como una variable importante considerando que las UTI son diagnosticadas con mayor frecuencia en los adultos mayores (Rowe & Juthani-Mehta, 2013). De acuerdo a la Organización Mundial de la Salud (OMS) un hombre o mujer que sobrepasa los 60 años se considera de la tercera edad. Los datos del presente estudio muestran que las mujeres con cáncer tienen una distribución de la edad con una mediana por debajo de los 60 años, mientras que los varones han tenido una mediana de edad superior a los 60 años. Es importante resaltar que a partir de los 50 años se incrementa la frecuencia de problemas de salud asociados a la próstata (cáncer e hiperplasia), lo cual como se ha indicado previamente puede asociarse al uso de catéter generando un riesgo para una ITU (Pow-Sang & Huamán, s. f.). El tratamiento de infecciones en pacientes con cáncer generalmente consiste en dos estrategias: (1) terapia empírica al inicio de la fiebre cuando una infección es probable o sospechada como la causa de la fiebre, y (2) terapia dirigida o específica, cuando una infección ha sido documenta y datos microbiológicos son disponibles (Rolston, 2009). El uso de antibióticos en pacientes con cáncer es frecuente y prolongado, y muchos centros de tratamiento del cáncer han reportado tasas crecientes de resistencia entre los patógenos 73 bacterianos (Rolston, 2005). La aparición de resistencia a los antimicrobianos entre pacientes con cáncer afecta no solo la decisión de la terapia antibiótica empírica inicial, sino también la elección de la terapia dirigida una vez que se aísla el patógeno (Gudiol & Carratalà, 2014). Una alta frecuencia de aislamientos BLEE positivos ha caracterizado a los aislamientos de E. coli y K. pneumoniae analizados en el presente estudio. Esta alta frecuencia de aislamientos BLEE positivos, concuerda con un estudio realizado en el Hospital Nacional Cayetano Heredia (2015) en pacientes ambulatorios con ITU por E coli donde se observó una frecuencia de aislamientos productores de BLEE del 41% (Castillo- Tokumori et al., 2017). Sin embargo, cada hospital puede mostrar una frecuencia de aislamientos BLEE diferente asociado al uso de antibióticos tal como lo ha mostrado Marcos-Carbajal y col., en un estudio analizando aislamientos de E. coli uropatógenas aisladas de diferentes hospitales del Perú (Marcos-Carbajal et al., s. f.). El uso intensivo de cefalosporinas de tercera generación ha sido asociado a la presencia de bacterias fenotipo BLEE positivo (Rahal, 1998). Esta asociación ha sido mostrada en estudios de intervención dirigidos a reducir el uso de cefalosporinas, que han derivado en la reducción de la incidencia de K. pneumoniae productora de BLEE (Avilés et al., s.f.). Aunque las infecciones por BLEE pueden ocurrir a todas las edades, a menudo se ha observado su predominio en pacientes de mayor edad. De hecho, aunque varios autores informaron que la edad mayor de 65 años es un factor predictivo de infección por BLEE, otros no lo han confirmado (Bouassida et al., 2016; Ena et al., 2006; Yang et al., 2010). En el presente estudio en pacientes con cáncer, no se ha encontrado evidencia que pueda indicar que los aislamientos de E. coli o K. pneumoniae BLEE positivo sean más frecuentes en el grupo de mayores de 65 años. 74 El presente estudio en pacientes con cáncer ha mostrado que el fenotipo BLEE positivo en E. coli y K. pneumoniae se observa con mayor frecuencia en los varones. Al- Garni y col., no encuentran asociación entre género y aislamientos de E. coli o K. pneumoniae BLEE positivos, siendo para este investigar un factor de riesgo importante la presencia de diabetes (Al-Garni et al., 2018). El sexo masculino ha sido identificado como factor de riesgo para la colonización intestinal por BLEE, que impacto pueda tener esta condición en las infecciones urinarias es un tema aun por explorar (Ben-Ami et al., s.f.; Díaz-Agero Pérez et al., 2019). En el Perú, las instituciones de salud tienen definidos protocolos para el tratamiento de una infección urinaria bajas no complicada. Así por ejemplo en el Hospital Nacional Cayetano Heredia (HNCH), el manejo empírico de una cistitis aguada donde no haya sospecha de una infección por un microorganismo productor de BLEE puede ser tratada con Nitrofurantoina o Cefalexima/Cefuroxima (Ministerio de Salud, 2015). En esta misma guía se indica ante la sospecha de una infección por microorganismos productores de BLEE el uso de Nitrofurantoina, Fosfomicina o Amoxicilina / Acido Clavulánico. Los resultados obtenidos en el presente estudio en pacientes con cáncer muestran que los aislamientos E. coli causantes de ITU muestran una importante susceptibilidad a Nitrofurantoina aun en aislamientos productoras de BLEE. Estos resultados tienen concordancia con los resultados indicados por Tasbakan y col. (Tasbakan et al., 2012). En el presente estudio, el efecto antibacteriano de la Nitrofurantoina ha disminuido de manera notable cuando se evalúa en K. pneumoniae, un resultado que guarda concordancia con los resultados indicados por Şay Coşkun (Şay Coşkun, 2019). Los aislamientos de E. coli y K. pneumoniae BLEE positivos y negativos causantes de ITU en pacientes con cáncer, muestran una importante 75 susceptibilidad a la Fosfomicina, la cual se muestra estable en el periodo de estudio. Este resultado justifica lo indicado en la guía del HNCH y también lo indicado por la “Guía de Práctica Clínica para el Manejo de la Infección del Tracto Urinario no Complicada” de ESSALUD (Instituto de Evaluación de Tecnologías en Salud e Investigación (IETSI ), 2019). Aunque la guía del HNCH indica como un antibiótico de elección a la Amoxicilina / Acido Clavulánico frente a una ITU por microorganismos BLEE positivos, los aislamientos de E. coli y K. pneumoniae del INEN muestra una frecuencia de resistencia del 100 %, lo cual descarta el uso de este antibiótico. En la guía de ESSALUD no se incluye a Amoxicilina / Acido Clavulánico como una alternativa para el manejo de ITU causadas por microorganismo BLEE positivos. El Índice de Resistencia Múltiple a Antibióticos (MARI) para los aislamientos de E. coli y K. pneumoniae uropatógenas del INEN muestra que ninguna ha sido pan-resistente pero que hay un entorno de alta presión selectiva hacia microorganismos cada vez más resistentes. El uso excesivo o inapropiado de antibióticos en el tratamiento de las infecciones urinarias es responsable de la aparición y propagación de bacterias urinarias resistentes a múltiples fármacos (El Bouamri et al., 2015). Los microorganismos uropatógenos resistentes a múltiples fármacos se están convirtiendo en una amenaza en expansión para la salud pública, ya que los miembros de la familia Enterobacteriaceae adquieren cada vez más β-lactamasas de espectro extendido (BLEE) como cefotaximasas (CTX-M) y oxacilinasas (OXA), β-lactamasas de tipo AmpC y carbapenemasas (Flores-Mireles et al., 2015). La mayoría de los factores de riesgo de resistencia a los antimicrobianos se han identificado en la población general no inmunodeprimida; sin embargo, los investigadores 76 que han investigado estos factores de riesgo en pacientes inmunocomprometidos con cáncer han encontrado que son similares en ambas poblaciones (Gudiol & Carratalà, 2014). En muchos países, las infecciones urinarias se trataban comúnmente con fluoroquinolonas, lo que ha resultado en un aumento rápido de la prevalencia de resistencia a quinolona en E. coli (Blaettler et al., 2009). En el presente estudio se ha observado un alto nivel de resistencia a quinolonas en E. coli y K. pneumoniae, los aislamientos BLEE positivo han mostrado un incremento adicional en la resistencia a quinolonas en relación a aquellas BLEE negativas. Diagbouga y col. (2016) reportaron la presencia de aislamientos de Klebsiella spp. productoras de BLEE resistentes a las quinolonas (ácido nalidíxico y ciprofloxacina), doxiciclina y trimetoprim-sulfametoxazol y también en menor medida a gentamicina y cloranfenicol (Diagbouga et al., 2016). La alta prevalencia de resistencia a múltiples fármacos indica una grave necesidad de vigilancia local amplia de resistencia a los antimicrobianos y planificación de intervenciones efectivas para reducir la resistencia a múltiples fármacos en dichos patógenos (Sandhu et al., 2016). En las bacterias Gram negativas, la resistencia a la Fosfomicina puede conferirse por diferentes mecanismos que incluyen: (i) defectos en los transportadores a través de la membrana citoplasmática, (ii) sustitución de aminoácidos en el sitio activo de la enzima UDP-N-acetilglucosamina-3-0-enolpiruvil transferasa (MurA) que disminuye la afinidad de unión a la Fosfomicina, y (iii) producción de la enzima inactivadora de Fosfomicina, FosA (Falagas et al., 2016). Se ha demostrado que la Fosfomicina tiene ventajas en el tratamiento de las infecciones urinarias debido a su alta concentración en el tracto urinario, que excede los 2.000 mg/L después de la administración inicial y permanece en niveles altos durante un 77 período prolongado (durante 24 horas). Sin embargo, la Fosfomicina no es sugerida para pielonefritis o pacientes hospitalizados con bacteriemia debido a concentraciones inadecuadas dentro del torrente sanguíneo (Raz, 2012). Para la vigilancia de la resistencia a los antibióticos, los datos básicos esenciales son generados por laboratorios de microbiología que rutinariamente identifican y determinan la susceptibilidad o resistencia de las bacterias aisladas de las muestras clínicas. Estos resultados se almacenan en el sistema informático de laboratorio y, si se accede a ellos, se recogen y se analizan, pueden informar sobre el grado de resistencia a los antibióticos que se observa en especies bacterianas o aislados de diferentes tipos de infección. Los cambios o variaciones en la resistencia a los antibióticos, ya sea geográficamente o con el tiempo, también se pueden controlar (Johnson, 2015). La vigilancia de la resistencia a los antibióticos desempeña un papel importante en el tratamiento hospitalario al proporcionar datos que influyen en la toma de decisiones clínicas, particularmente la elección de antibióticos para ser utilizados tanto para el tratamiento empírico de pacientes con sospecha de infecciones como para la profilaxis en pacientes con mayor riesgo de infección (Johnson, 2015). Es indispensable continuar implementando e intensificando estrategias que disminuyan la presión selectiva mediante el uso racional de antibióticos, de escalamiento de antimicrobianos (reducción del uso de antimicrobianos de amplio espectro, disminución del número de antibacterianos y menor duración de la terapia) y reforzar los programas para la prevención de infecciones nosocomiales (Arancibia, 2019; Velázquez-Acosta et al., 2016). Por ejemplo, en Australia, se recomienda reservar la Fosfomicina para el tratamiento de la infección urinaria no complicada en pacientes cuando los medicamentos estándar de primera 78 línea no son una opción. Parte de la lógica detrás de esto es minimizar la aparición de resistencia y prolongar la utilidad de la Fosfomicina para pacientes sin opciones alternativas (Gardiner et al., 2019). 79 VI. Conclusiones 6.1. En pacientes con cáncer del INEN se ha observado una alta frecuencia de aislamientos de E. coli y K. pneumoniae productoras de -lactamasas de espectro extendido (BLEE) causantes de infección urinaria. 6.2. En pacientes con cáncer del INEN se ha observado que los aislamientos de E. coli y K. pneumoniae productoras de BLEE se encuentran con mayor frecuencia en los varones. 6.3. En pacientes con cáncer del INEN no se ha observado una evidencia que relacione la edad con los aislamientos de E. coli y K. pneumoniae productoras de BLEE 6.4. Aunque el fenotipo BLEE positivo también ejerce un impacto sobre la susceptibilidad a Fosfomicina, este antibiótico aún conserva una importante actividad sobre las cepas de E. coli y K. pneumoniae BLEE positivo preservando el uso de antibióticos de mayor potencia para situación de mayor complejidad. 6.5. En aislamientos de E. coli y K. pneumoniae productoras de BLEE las quinolonas y SXT muestran una preocupante disminución de su efecto antimicrobiano, indicando que la Fosfomicina es una alternativa en el manejo de ITU. 6.6. Las cefalosporinas de tercera generación carecerían de utilidad clínica frente a aislamientos de E. coli y K. pneumoniae productoras de BLEE. 6.7. El INEN es un entorno de alta presión selectiva que genera aislamientos de E. coli y K. pneumoniae resistentes a antibióticos asociados a ITU. 80 VII. Recomendaciones 7.1. Realizar un estudio retrospectivo de la frecuencia de uso de cefalosporinas de tercera generación en pacientes con cáncer tanto hospitalizados como ambulatorio a fin de establecer la dinámica de la aparición de aislamientos BLEE positivos. 7.2. Realizar un estudio de la prevalencia de infecciones por microorganismos BLEE positivos en pacientes con cáncer. 7.3. Incorporar herramientas de biología molecular a fin de realizar estudios de epidemiología molecular que permitan hacer un seguimiento de las fuentes de origen de la dispersión de microorganismos BLEE positivos en pacientes con cáncer. 81 VIII. Referencias Aguilar, M. D. (2017). Nuevas aportaciones de Fosfomicina frente a Pseudomonas aeruginosa: Caracterización fenotípica y molecular de la resistencia, asociaciones antibióticas y modelos de biopelículas. Universidad Complutense de Madrid. Al-Garni, S. M., Ghonaim, M. M., Ahmed, M. M. M., Al-Ghamdi, A. S., & Ganai, F. A. (2018). Risk factors and molecular features of extended-spectrum beta-lactamase producing bacteria at southwest of Saudi Arabia. Saudi Med J., 39(12), 1186-1194. Ana Ma García-Hernández, Elisa García-Vázquez, Alicia Hernández-Torres, Joaquín Ruiz, Genoveva Yagüe, José Antonio Herrero, & Joaquín Gómez. (2011). 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Anexos Anexo A Definición de términos  Betalactamasas: son enzimas capaces de inactivar los antibióticos de la familia betalactámicos (penicilinas, cefalosporinas, monobactámicos y carbapenémicos).  Cabapenemasas: Las Enterobacterias productoras de carbapenemasas (KPC) son bacterias que tienen la capacidad de producir enzimas que llevan este nombre (carbapenemasas) que les dan la posibilidad de destruir muchos tipos de antibióticos, haciendo que la bacteria tenga mayor resistencia.  Resistencia intrínseca: La resistencia antibiótica es la capacidad de un microorganismo para resistir los efectos de un antibiótico. La resistencia se produce naturalmente por selección natural a través de mutaciones producidas por azar.  Resistencia múltiple o multirresistencia: Se utiliza cuando una cepa bacteriana es resistente a varios antimicrobianos o tipos de antimicrobianos distintos.  Resistencia cruzada: son aquellas que han desarrollado métodos de supervivencia eficaces frente a distintos tipos de moléculas antimicrobianas con uno o varios mecanismos de acción similares.  In vitro: se refiere a una técnica para realizar un determinado experimento en un tubo de ensayo, o generalmente en un ambiente controlado fuera de un organismo vivo.  Antimicrobiano: es una sustancia que elimina microorganismos o inhibe su crecimiento, tales como bacterias, hongos o parásitos. 94  Bacteriuria asintomática: Se refiere a la presencia significativa de la cantidad de bacterias presentes en una muestra de orina, que fue colectada de un paciente sin síntomas de infección, el cual fue enviado al laboratorio para un cultivo de orina.  ITU no complica: generalmente se define como las que ocurren en mujeres pre menopaúsicas sanas que tienen el riñón y las vías urinarias normales las ITU no complicadas incluyen infecciones del tracto superior (pielonefritis), como del tracto inferior (cistitis).  ITU complicada: generalmente se desarrolla en pacientes con sistemas del tracto urinario que son estructural o funcionalmente anormales debido a factores intrínsecos o extrínsecos. 95 Anexo B Ficha de recolección de datos